在了解到設計所需的所有條件、需求以及要求后，之后就是對整個設計范圍劃分系統(tǒng)，系統(tǒng)該如何劃分，這個在潔凈廠房設計規(guī)范里有明確的建議：
1、運行班次或者使用時間不同；
2、生產(chǎn)工藝中某工序散發(fā)的物質(zhì)或氣體對氣體工序的產(chǎn)品質(zhì)量有影響；
3、對溫、濕度控制要求差別大；
4、凈化空調(diào)系統(tǒng)與一般空調(diào)系統(tǒng)；
這是規(guī)范中給出的系統(tǒng)劃分原則，后面經(jīng)過總結，又將其進行了細化，分為以下部分：
1、潔凈度，溫、濕度及其精度相同或相近的潔凈房間宜劃為一個凈化空調(diào)系統(tǒng)。便于潔凈度和溫、濕度的控制。
備注：因為集中空調(diào)都是統(tǒng)一的送風溫差，如果不同房間溫濕度及其精度要求不同，那么在這個統(tǒng)一的送風溫差的基礎上就很難去保證每個房間都達到設計要求。
2、距離較近的潔凈房間宜劃為一個系統(tǒng)，可減少系統(tǒng)管道的長度和管道交叉。
備注：集中空調(diào)都是通過風管去送風，如果同一個系統(tǒng)離的太遠，那么風管就太長，阻力大，平衡不好控制，而且還浪費風管。
3、有條件時可將4級、5級單向流和6級、7級、8級非單向流組成混合流凈化空調(diào)系統(tǒng)。
備注：這條在醫(yī)藥上用的比較多，比如醫(yī)藥的*，類似于5級，因為做出5級的環(huán)境耗費頗大，所以一般只要求局部做成5級（也就是工藝需要的小范圍區(qū)域，5級屬于單向流），而大環(huán)境有B級即可，B級使用非單向流就可以滿足條件。
4、潔凈室不宜與一般空調(diào)房間合為一個系統(tǒng)。
備注：之所以潔凈室與一般空調(diào)不宜用在一個系統(tǒng)，有很多方面的原因，比如送風末端不同，阻力不同，潔凈室用的風口，阻力大，而一般空調(diào)用百葉或者散流器，阻力小，這就不好去調(diào)節(jié)，而且他們在使用時間上也一般不相同，同時如果一般空調(diào)直接回風的話，還存在一定的污染風險。
5、使用規(guī)律和使用時間不相同的潔凈室不宜合為一個凈化空調(diào)系統(tǒng)。
備注：潔凈空調(diào)耗能特別大，所以如果可以不使用的話，則能少使用，特別是一些工廠的生產(chǎn)線，可能會存在一條線生產(chǎn)，另一條線不生產(chǎn)的情況，所以這種情況下，如果都設計成一個系統(tǒng)，那么久存在大量的浪費，一般業(yè)主也不會允許。
6、產(chǎn)塵量大、發(fā)熱量大、有害物多、噪聲大的房間宜單獨設計為一個系統(tǒng)。
備注：發(fā)熱量大，就會存在風量的負荷計算過大的問題，與其他房間相比，同樣的送風溫差下，要送更多的風，也存在個浪費。
7、混合后會產(chǎn)生劇毒、引起火災和爆炸的房間不應合為一個凈化空調(diào)系統(tǒng)。
備注：凈化空調(diào)為了節(jié)能，能夠回收利用的空氣，都不會直接排放，可是不同房間的回風如果混合了產(chǎn)生問題，就不值得了。
8、易燃易爆的甲、乙類房間應單獨設系統(tǒng)，而且應為不回風的直流系統(tǒng)。
備注：這是為了保證安全性，雖然用在一個系統(tǒng)，只送風，全排，理論上不存在交叉污染的問題，但這是理論上，實際使用中，因為誤操作等原因，產(chǎn)生問題也是有可能的。
9、一個凈化空調(diào)系統(tǒng)不易過大。一般情況下，凈化送風量不宜超過100,000 m³/h，否則空氣處理設備過大、噪聲大、送回風管道大、占空間和面積大，使用也不靈活。
備注：風量過大，風管就太大了，相應的各方面都存在問題，所以一般都不會設計的太大。
10、凈化空調(diào)系統(tǒng)劃分時還應考慮到送風管、回風管、排風管以及水,電,氣等管線的布置，盡量作到合理、短捷、使用管理方便，盡量減少交叉和重疊。
備注：潔凈室的系統(tǒng)太多，需要占用大量的吊頂空間，所以在可能的前提下，盡量節(jié)省空間，一個項目設計完必然要做空間管理。
11、凈化空調(diào)系統(tǒng)新風的熱濕和凈化處理可集中也可分散設置。
備注：如果系統(tǒng)過多，新風較大，新風集中處理，非常節(jié)能，而且潔凈室的污染經(jīng)常是來個室外新風，所以將新風獨立出來單獨處理，可以減少其他空調(diào)過濾器更換的時間，當然了，畢竟新風處理要單獨設計一臺新風機組MAU，成本增加了，所以新風太少，就不值得這么做了。